Kızlarda doğurganlık fazla etkilenmez. Kistik fibrozisli kızların çoğu gebe kalabilir. Gebelik süresince annenin beslenme durumu bebeği etkiliyebilir.
Erkeklerin ise %98’inde fertilite etkilenir. Bebeğin sperm kanallarının etkilenmesi önemli bir faktördür.